Porażeniu ulegają owoce w różnym stadium rozwoju, ale najbardziej podatne są w fazie wybarwiania. Rozwojowi choroby sprzyjają lata z dużą ilością opadów w okresie dojrzewania wiśni. Objawy choroby w postaci gnilnych plam na owocach mogą być widoczne już w sadzie. Czasami jednak choroba może mieć przebieg utajony i owoce gniją dopiero podczas przechowywania i transportu. Porażone, zmumifikowane owoce, pozostawione w sadzie są źródłem zakażenia w następnym sezonie. Opryskiwania przeciwko gorzkiej zgnilizny owoców należy rozpocząć 3 tygodnie po kwitnieniu i kontynuować 2-3 razy co 10-14 dni z zachowaniem okresu karencji. Szczególnie ważny jest ostatni zabieg w okresie wybarwiania się wiśni, zwłaszcza gdy występują duże ilości opadów.